2019年1月，研究组周继云博士的论文《Prediction of TF-binding site by inclusion of higher order position dependencies》获IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB)录用。

基于已有的转录因子结合位点预测方法无法抽取DNA序列中不同位置核苷酸残基之间的高阶依存关系，本文提出了一种新的转录因子结合位点预测方法CNN_TF，该方法通过在蛋白修饰特征上使用卷积神经网络抽取目标DNA序列的高阶依存关系。此外，CNN_TF方法还能通过在DNA序列上使用卷积神经网络抽取低阶依存关系。最后抽取的高阶依存关系和低阶依存关系可用于预测转录因子结合位点。实验结果显示该方法不仅能有效提高转录因子结合位点的预测性能，还能促进人们对基因表达调控过程的理解。

TCBB是生物信息学领域的国际顶级学术期刊，在中国计算机学会推荐会议列表中被分为C类期刊, 该期刊为SCI检索，IF 2.428，JCR二区。

论文信息：

Zhou, Q. Lu, R. Xu, L. Gui and H. Wang, “Prediction of TF-binding site by inclusion of higher order position dependencies,” IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics.