2018年7月,研究组周继云博士的论文《EL_LSTM: Prediction of DNA-binding residue from Protein sequence by Combining Long Short-Term Memory and Ensemble Learning》获IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB)录用。

已有的DNA结合位点预测方法无法同时抽取目标位点的上下文信息和远距离依存关系,以及无法处理正负样本数量的不平衡问题。本文通过结合使用LSTM和集成学习抽取目标位点的上下文信息和远距离依存关系,并高效地解决正负样本的不平衡问题。实验结果显示该方法有效提高了DNA结合位点的预测性能。
TCBB是生物信息学领域的国际顶级学术期刊,在中国计算机学会推荐会议列表中被分为C类期刊, 该期刊为SCI检索,IF 2.428,JCR二区。
论文信息:
J. Zhou, Q. Lu, R. Xu, L. Gui and H. Wang, “EL_LSTM: Prediction of DNA-binding residue from Protein sequence by Combining Long Short-Term Memory and Ensemble Learning,” IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. doi: 10.1109/TCBB.2018.2858806,
URL:http://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=8417936&isnumber=4359833