2017年8月，研究组博士生周继云的论文《EL_PSSM-RT: DNA-binding residue prediction by integrating ensemble learning with PSSM Relation Transformation》被BMC Bioinformatics期刊录用并在线发表。

对于DNA结合位点预测问题，已有方法通常存在两个问题：（1）在使用序列进化信息PSSM矩阵作为特征时，没有考虑序列中各位点之间的进化相互关系；（2）数据集中的正负样本数量存在严重的不平衡问题，已有的方法并没有很好的解决此问题。本文分别使用PSSM关系转化方法和集成学习解决了这两个问题。实验结果表明本文提出的方法有效提高了DNA结合位点预测的性能。

《BMC Bioinformatics》期刊 SCI检索，影响因子2.448，JCR分区为Q1。

Jiyun Zhou, Qin Lu, Ruifeng Xu, Yulan He and Hongpeng Wang. EL_PSSM-RT: DNA-binding residue prediction by integrating ensemble learning with PSSM Relation Transformation. BMC Bioinformatics . Vol.18, No.1, 379, DOI: 10.1186/s12859-017-1792-8

论文网址：https://doi.org/10.1186/s12859-017-1792-8