2016年10月，研究组硕士生魏琪康和博士生陈涛等的论文《Disease named entity recognition by combining conditional random fields and bidirectional recurrent neural networks》被《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》期刊接收。

本文的研究对象是医疗文献摘要中疾病命名实体的抽取和标准化。针对数据集的特点，提出了一种基于条件随机场和Bi-RNN的命名实体抽取方法和基于向量空间模型的实体标准化方法。首先，使用人工特征的条件随机场和自动向量特征表示的Bi-RNN分别抽取疾病命名实体；随后，使用支持向量机结合其他特征和上述抽取结果进行分类标注；最后，使用向量空间模型标准化处理抽取到的命名实体。实验结果显示该方法在疾病命名实体抽取和标准化领域具有较好的性能。

牛津大学出版社的《Database: The Journal of Biological Databases and Curation》是JCR 1区、中科院 2区期刊，SCI影响因子2.627；该期刊在汤森路透统计的56种计算生物学期刊中列第8位。

论文网址：http://database.oxfordjournals.org/content/2016/baw140.full